密码子使用偏好性

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密码子使用偏好性

密码子数据库及密码子偏好性分析摘要: 转基因研究中经常要进行基因的异源表达,在翻译过程中,受体物种对外源基因密码子的翻译效率对表达有非常大的制约。因此,利用相应的生物信息学数据库及软件对目标序列进行受体物种的密码子偏好性分析将有助于完成对转基因效率的评价,适当选择合适的受体物种进行高效、可行的表达。在众多的分析工具中,用于密码子使用统计的Codon Usage Database数据库及用于密码子偏好性分析的Graphical codon usage analyse是最为常用的软件系统,本文将以二者为例对密码子数据库及密码子偏好性分析进行简要的介绍。关键词:转基因 异源表达 密码子偏好性 生物信息学一:密码子使用统计数据库Codon Usage Database( 是由植物基因研究第一实验室(The First Laboratory for Pl......阅读全文

密码子的应用-预测进化规律

预测进化规律类似的密码子使用模式,预示着物种相近的亲缘关系或生存环境。目 前已有研究通过比较密码子偏性的差异程度,来分析物种间的亲缘关系和进化历程。线粒体基因组具有母系遗传、分子结构简单、多态性丰富等优点,是一种重要的分子标记,研究其密码子使用偏好性,可以很好地用于确定动物类群的遗传分化和系统发生关

椭偏仪简介

椭偏仪是一种用于探测薄膜厚度、光学常数以及材料微结构的光学测量仪器。由于测量精度高,适用于超薄膜,与样品非接触,对样品没有破坏且不需要真空,使得椭偏仪成为一种极具吸引力的测量仪器。早期的椭偏研究主要集中于偏振光及偏振光与材料相互作用的物理学研究以及仪器的光学研究。计算机的发展和应用使椭偏数据

偏摆仪简介

偏摆仪分为新型偏摆检查仪、齿轮跳动检查仪、花岗石偏摆检查仪。偏摆仪主要用于检测轴类、盘类另件的径向、圆跳动和端面圆跳动。该仪器利用两定位轴类零件,转动被测零件,测头在被测零件径向方向上直接测量零件的径向跳动误差。一、新型偏摆检查仪配有一对莫氏4#硬质,提高了偏摆仪的测量精度,增大了对被测零件的支撑重

徐彦辉等《自然》揭示TET蛋白底物偏好性机制

今天,国际顶级学术期刊《自然》(Nature)在线发表了复旦大学生物医学研究院徐彦辉教授课题组的论文。该项研究成果揭示了TET蛋白底物偏好性机制,对研究多种疾病的发病机制,尤其对血液肿瘤(如髓系白血病)治疗性药物开发有重大意义。这 篇题为“晶体结构揭示TET蛋白介导的氧化反应底物偏好性机制”

椭偏仪的构造

在光谱椭偏仪的测量中使用不同的硬件配置,但每种配置都必须能产生已知偏振态的光束。测量由被测样品反射后光的偏振态。这要求仪器能够量化偏振态的变化量ρ。有些仪器测量ρ是通过旋转确定初始偏振光状态的偏振片(称为起偏器)。再利用第二个固定位置的偏振片(称为检偏器)来测得输出光束的偏振态。另外一些仪器

椭偏仪的应用

应用领域半导体、微电子、MEMS、通讯、数据存储、光学镀膜、平板显示器、科学研究、物理、化学、生物、医药[2]…可测材料半导体、介电材料、有机高分子聚合物、金属氧化物、金属钝化膜、自组装单分子层、多层膜物质和石墨烯等等[1]

椭偏仪的历史

早期的椭偏研究主要集中于偏振光及偏振光与材料相互作用的物理学研究以及仪器的光学研究。计算机的发展和应用使椭偏数据的拟合分析变得容易,促使椭偏仪在更多的领域得到应用。硬件的自动化和软件的成熟大大提高了运算的速度,成熟的软件提供了解决问题的新方法,因此,椭偏仪已被广泛应用于材料、物理、化学、生物、医

基因组所设计开发出检测密码子使用偏好的新算法

近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员带领其团队,成功设计开发出检测密码子使用偏好(Codon Usage Bias,简称CUB)的新算法:密码子偏差系数模型(Codon Deviation Coefficient,简称CDC)。该研

揭示哺乳动物两性存在性别偏好性的基因表达

在一项新的研究中,来自来自美国怀特黑德研究所、麻省理工学院和哈佛医学院的研究人员发现了雄性和雌性哺乳动物在基因表达上的全基因组差异。相关研究结果发表在2019年7月19日的Science期刊上,论文标题为“Conservation, acquisition, and functional im

密码子的应用-翻译起始效应

mRNA浓度是翻译起始速率的主要影响因素之一,密码子直接影响转录效率,决定mRNA浓度。如单子叶植物在“翻译起始区”的密码子偏性大于“翻译终止区”,暗示“翻译起始区”的密码子使用对提高蛋白质翻译的效率和精确性更为重要,因此,通过修饰编码区5′端的DNA序列,来提高蛋白质的表达水平将有望成为可能。

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作者:上网导航本文地址:https://www.90xe.com/post/6692.html发布于 2023-12-04
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